Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIFAP3Q92845 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms