Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL2Q92772 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms