Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
TNRQ92752 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNRQ92752 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNRQ92752 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNRQ92752 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNRQ92752 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNRQ92752 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNRQ92752 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNRQ92752 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNRQ92752 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNRQ92752 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNRQ92752 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNRQ92752 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TNRQ92752 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNRQ92752 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNRQ92752 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TNRQ92752 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNRQ92752 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNRQ92752 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNRQ92752 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNRQ92752 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNRQ92752 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNRQ92752 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNRQ92752 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRQ92752 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNRQ92752 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TNRQ92752 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNRQ92752 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TNRQ92752 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNRQ92752 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
TNRQ92752 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
TNRQ92752 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNRQ92752 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNRQ92752 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNRQ92752 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNRQ92752 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNRQ92752 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNRQ92752 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNRQ92752 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNRQ92752 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNRQ92752 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TNRQ92752 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNRQ92752 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TNRQ92752 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNRQ92752 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNRQ92752 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNRQ92752 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRQ92752 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRQ92752 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRQ92752 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRQ92752 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRQ92752 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRQ92752 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRQ92752 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRQ92752 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRQ92752 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRQ92752 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNRQ92752 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNRQ92752 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNRQ92752 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TNRQ92752 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNRQ92752 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNRQ92752 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNRQ92752 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNRQ92752 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNRQ92752 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNRQ92752 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNRQ92752 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNRQ92752 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNRQ92752 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNRQ92752 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNRQ92752 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNRQ92752 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNRQ92752 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNRQ92752 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNRQ92752 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRQ92752 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRQ92752 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRQ92752 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRQ92752 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRQ92752 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRQ92752 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRQ92752 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRQ92752 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
TNRQ92752 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TNRQ92752 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TNRQ92752 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TNRQ92752 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TNRQ92752 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms