Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DHX38Q92620 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX38Q92620 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms