Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN4Q92575 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN4Q92575 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms