Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms