Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF2Q8TEC5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms