Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC43.82■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC43.77■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC43.69■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms