Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNPDA2Q8TDQ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms