Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEK9Q8TD19 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK9Q8TD19 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms