Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBA3Q8TBC4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA3Q8TBC4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms