Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSDMBQ8TAX9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMBQ8TAX9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms