Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCPH1Q8NEM0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCPH1Q8NEM0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms