Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms