Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG16L2Q8NAA4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms