Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR7Q8N806 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms