Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC155Q8N6L0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms