Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC9Q8N567 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC9Q8N567 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms