Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD4Q8N4Q1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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