Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO39Q8N4B4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms