Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYBPQ8N488 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms