Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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SDR16C5Q8N3Y7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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SDR16C5Q8N3Y7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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SDR16C5Q8N3Y7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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SDR16C5Q8N3Y7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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SDR16C5Q8N3Y7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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SDR16C5Q8N3Y7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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SDR16C5Q8N3Y7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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SDR16C5Q8N3Y7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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SDR16C5Q8N3Y7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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SDR16C5Q8N3Y7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR16C5Q8N3Y7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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