Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms