Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms