Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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