Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W7

FMR1NB, Fragile X mental retardation 1 neighbor protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1NBQ8N0W7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FMR1NBQ8N0W7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FMR1NBQ8N0W7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMR1NBQ8N0W7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMR1NBQ8N0W7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms