Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1Q8N0S2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE1Q8N0S2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1Q8N0S2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms