Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT1Q8IXI2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT1Q8IXI2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOT1Q8IXI2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms