Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC117Q8IWD4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC117Q8IWD4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms