Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR49Q8IV35 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms