Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNEQ86WN2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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