Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF39Q86UA1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF39Q86UA1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms