Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PBRM1Q86U86 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PBRM1Q86U86 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms