Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF554Q86TJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms