Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms