Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms