Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.279e-8■■■■□ 22.6
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SND1Q7KZF4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.621e-20■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-20■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 CADM1-217ENST00000545094 581 ntTSL 34.56□□□□□ -1.685e-7■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 ASNS-202ENST00000394308 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-8■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.695e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.665e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.655e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.635e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.495e-16■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-9■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 NOMO2-206ENST00000564991 3765 ntTSL 517.85■□□□□ 0.452e-9■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)17.27■□□□□ 0.355e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.275e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 SIL1-204ENST00000503732 690 ntTSL 314.99□□□□□ -0.011e-7■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 SPAG5-214ENST00000582076 719 ntTSL 314.51□□□□□ -0.095e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 TPD52L1-209ENST00000530868 650 ntTSL 314.02□□□□□ -0.175e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 ATF3-208ENST00000465155 1626 ntTSL 213.94□□□□□ -0.185e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 TPD52L1-216ENST00000571678 2486 nt13.92□□□□□ -0.185e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 HEXA-204ENST00000564677 572 ntTSL 213.87□□□□□ -0.194e-7■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.235e-6■■■■□ 22.5
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