Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms