Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWJ1

STXBP4, Syntaxin-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STXBP4Q6ZWJ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STXBP4Q6ZWJ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STXBP4Q6ZWJ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms