Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms