Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms