Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYHR1Q6ZMK1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYHR1Q6ZMK1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms