Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUC6Q6W4X9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms