Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC171Q6TFL3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms