Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD1Q6SPF0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms