Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC11Q6PKC3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC11Q6PKC3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms