Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAT1Q6PJG6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAT1Q6PJG6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms