Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPH4

XAF1, XIAP-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAF1Q6GPH4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XAF1Q6GPH4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XAF1Q6GPH4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms