Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC19Q6DKK2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.4 ms