Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD40Q6AI12 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms